在秋天的七月，首先进行了太庙的祭祀活动。

然后，皇帝任命贝勒勒克德浑为平南大将军，与固山额真叶臣等人一同前往江南，接替多铎的职务。

为了表示对明太祖的尊重，设置了四名守陵太监，并分配了二千亩的祀田。

不久后，明东平侯刘泽清率领他的部下投降了。

在人事方面，刘应宾被任命为安庐巡抚，土国宝为江宁巡抚，而谢弘仪则被派去招抚广西。

皇帝还下令，军民在服饰上必须遵守国家的规定。

同时，何鸣銮被任命为湖广巡抚，高斗光为偏沅巡抚，潘士良则负责郧阳的抚治工作。

皇帝还向上太祖武皇帝、孝慈武皇后、太宗文皇帝在太庙中供奉了玉册玉宝。

为了减轻百姓的负担，皇帝决定免除西安、延安等地的部分税收。

同时，西平地区的叛乱首领刘洪被诛杀，汝宁的州县都得以平定。

黄河在兖西决堤，但新的月堤被迅速筑起以防止进一步的灾害。

在八月，皇帝又免除了霸、顺义等八个州县的灾害赋税，以及彰德、卫辉、怀庆、河南各府的荒赋。

英亲王阿济格在战争结束后回到朝廷，皇帝根据战功赏赐了外藩王、台吉、将佐等人。

同时，由于金声桓的投降，他成功讨伐了故明益王，并俘虏并处决了王养正等人。

然而，因为阿济格在出征中有过错，他的爵位被降为郡王，谭泰也被削去公爵，降为昂邦章京，而鳌拜等人则受到了不同程度的处罚。

九月，故明鲁王的将领方国安和王之仁侵犯杭州，但被张存仁击退。

为了加强江西的防务，皇帝派遣了镇国公傅勒赫、辅国公札喀纳等人率兵前往。

随后，故明怀安王投降了清朝。

不久后，故明新昌王占据云台山并攻击兴化，但被准塔击败并斩首。

为了恢复农业生产，皇帝决定将河间、滦州、遵化的荒地分给八旗耕种，并将故明勋戚内监的余地也分给八旗。

最后，田仰侵犯福山，但被土国宝击败。

在江西的南昌等地，十一个府都被平定。

十月癸未日，皇帝任命马国柱为宣大总督。

戊子日，前明朝的翰林金声接受唐王的命令，在徽州起兵，兵力达到十余万。

然而，洪承畴派遣的提督张天禄在绩溪连连击败他们，捕获了金声。

金声不屈服，最终被杀害。

此时，前明朝的唐王朱聿钊占据福建，鲁王朱彝垓占据浙江，马士英等人则渡过钱塘江结营抗命。

庚寅日，皇帝免除了宝坻县的荒赋。

壬辰日，又免除了太原等府州的灾赋。

癸巳日，豫亲王多铎率军返回，皇帝亲自到南苑迎接并慰劳他。

丙申日，任命苗胙土为南赣巡抚。

乙巳日，太宗的次女固伦公主下嫁给察哈尔汗子阿布鼐。

丙午日，任命申朝纪为山西巡抚，李翔凤为江西巡抚，萧起元为浙江巡抚。

戊申日，加封和硕豫亲王多铎为和硕德豫亲王，并赐予随征的王、贝勒、贝子、公以及外藩台吉、章京等人不同等级的金币。

同时，命令孔有德、耿仲明返回盛京。

十一月壬子日，任命张存仁为浙闽总督，罗绣锦为湖广四川总督。

癸丑日，前明朝的大学士王应熊、四川巡抚龙文光请求投降。

甲寅日，任命吴景道为河南巡抚，命令巴山、康喀赖为左右翼，与洪承畴一同驻防江宁，朱玛喇驻防杭州。

同时，贝勒勒克德浑率领巩阿岱、叶臣等人讨伐湖广的流贼二只虎等人。